KITS SNP-PCR para el Genotipado CEPAS COVID


SNPsig ® SARS-CoV-2 real-time PCR mutation detection/allelic discrimination kits

Se realizó un estudio exhaustivo de las secuencias de estas variantes para encontrar identificado­res únicos de estas cepas y elegir el SNP (polimorfismo de nucleótido simple) óptimo para cada una de ellas que permitan su identificación.
Los kits SNP-PCR están diseñados para realizar el genotipado a partir de eluidos positivos en SARS-CoV-2, por lo tanto, primero se realiza la confirmación con la metodología adecuada y des­pués se utiliza esta técnica. Esto nos asegura una identificación óptima de cepas.
Actualmente se está utilizando el fallo de la amplificación del gen S como herramienta para sospe­char la presencia de estas cepas. Sin embargo, dada la naturaleza compartida de estas mutacio­nes y la creciente evidencia para la evolución convergente, se necesitan pruebas más específicas para definir estas cepas.
El análisis de SNP mediante PCR para la identificación de genotipos es una técnica muy específica e incluso alternativa a la secuenciación NGS.

Principio del TEST

Cada mezcla de sondas/cebadores contiene dos sondas homólogas a los genotipos sometidos a investigación (genotipo salvaje, genotipo mutante) y marcadas con un fluoróforo distinto. Durante la amplificación de qPCR las sondas competirán por la unión en la región variante. La sonda que es 100% homóloga al sitio de unión del ARN se unirá preferentemente y dará una señal fuerte de fluorescencia.
De ello se deduce que cuando la secuencia diana es de tipo salvaje dará un gráfi­co de amplificación fuerte a través de un canal mientras da una señal muy débil a través del canal alternativo y cuando la secuencia diana es de tipo mutante se obtendrán resultados inversos:

Disponemos de tres kits para la identificación de las nuevas cepas.

Dos específicos; uno para la británica y otro la sudafricana y un tercero para screening de las cepas británica, sudafricana y brasileña.
Viene liofilizado para viajar a temperatura ambiente y evitar problemas de degradación.